Fiddyastuti, Desynta dan Rachmania, Rizky Arcinthya dan Hariyanti, Hariyanti (2020) MOLECULAR DOCKING DAN MOLECULAR DYNAMICS SENYAWA MINYAK ATSIRI HERBA TIMI (Thymus vulgaris) SEBAGAI ANTITUBERKULOSIS TERHADAP ENOYL-ACYL CARRIER PROTEIN (ACP)-REDUCTASE (InhA). Bachelor thesis, Universitas Muhammadiyah Prof. DR. HAMKA.
Preview |
Text
FS03-220038.pdf Download (1MB) | Preview |
Abstract
Tuberkulosis (TB) merupakan penyakit menular yang disebabkan oleh bakteri
Mycobacterium tuberkulosis (MTB). Herba timi (Thymus vulgaris) menjadi salah
satu tumbuhan yang senyawa minyak atsirinya telah diteliti dengan menunjukan
aktivitas menghambat pertumbuhan bakteri MTB. Tujuan penelitian ini untuk
memprediksi kandidat pada senyawa dalam minyak atsiri dari herba timi terhadap
reseptor target enoyl-acyl carrier protein (ACP)-reductase (Inha) pada dinding sel
bakteri dengan menggunakan obat pembanding yaitu Isoniazid. Penelitian ini
menggunakan metode molecular docking dengan software Autodock untuk
mengetahui senyawa dalam minyak atsiri dari herba timi yang memiliki potensi
terbaik sebagai kandidat antituberkulosis dilihat dari energi ΔG, kluster, dan Ki
serta menggunakan metode molecular dynamics dengan software GROMACS
untuk melihat kestabilan melalui analisis energi potensial, RMSD, RMSF, Girasi,
dan MMPBSA. Hasil penelitian dengan metode molecular docking berdasarkan
parameter energi ΔG, kluster, dan Ki senyawa -Cadinol, τ-Cadinol, dan
Camphora diprediksi memiliki afinitas yang baik dan hasil dari metode molecular
dynamics berdasarkan parameter MMPBSA menunjukan bahwa -Cadinol, τCadinol, dan Camphora menunjukan kestabilan yang baik selama simulasi
molecular dynamics. Kesimpulan dari penelitian ini yaitu senyawa -Cadinol, τCadinol, dan Camphora dari herba timi mempunyai potensi sebagai kandidat obat
antituberkulosis.
Kata Kunci: Thymus vulgaris, Enoyl-Acyl Carrier Protein (ACP)-Reductase
(Inha), Antituberkulosis, Molecular Docking, dan Molecular
Dynamics
Item Type: | Thesis (Bachelor) |
---|---|
Subjects: | R Medicine R Medicine > RS Pharmacy and materia medica |
Divisions: | Fakultas Farmasi dan Sains > Farmasi |
Depositing User: | libffs libffs libffs |
Date Deposited: | 02 Apr 2023 10:31 |
Last Modified: | 02 Apr 2023 10:31 |
URI: | http://repository.uhamka.ac.id/id/eprint/21774 |
Actions (login required)
View Item |