IMULASI MOLECULAR DOCKING DAN MOLECULAR DYNAMIC SENYAWA-SENYAWA PADA BIJI NANGKA (Artocarpus heterophyllus Lam.) TERHADAP RESEPTOR PEROXISOME PROLIFERATOR ACTIVATED RECEPTOR GAMMA SEBAGAI ANTIDIABETES MELITUS TIPE II

Silviani, Safirah Nisa dan Rachmania, Rizky Arcinthya dan Yeni, Yeni (2020) IMULASI MOLECULAR DOCKING DAN MOLECULAR DYNAMIC SENYAWA-SENYAWA PADA BIJI NANGKA (Artocarpus heterophyllus Lam.) TERHADAP RESEPTOR PEROXISOME PROLIFERATOR ACTIVATED RECEPTOR GAMMA SEBAGAI ANTIDIABETES MELITUS TIPE II. Bachelor thesis, Universitas Muhammadiyah Prof. DR. HAMKA.

Preview

Text FS03-220157.pdf Download (1MB) | Preview

Abstract

Diabetes melitus tipe 2 terjadi akibat tubuh tidak bisa menggunakan produksi
insulin dengan efektif, sehingga kadar glukosa normal dalam darah tidak
tercapai.PPARγ berperan dalam proses sensitisasi insulin, dan digunakan sebagai
target terapi diabetes melitus tipe 2. Tujuan penelitian ini untuk mengetahui
senyawa yang memiliki aktivitas lebih baik dari biji buah nangka dibandingkan
obat antidiabetes melitus yaitu golongan tiazolidindion dan menguji kestabilan
senyawa biji buah nangka. Metode yang digunakan untuk penelitian ini yaitu
Molecular docking dan molecular dynamic. Ligan yang digunakan terdiri dari
ligan pembanding pioglitazon, dan delapan belas senyawa ligan dari biji buah
nangka. Sedangkan untuk reseptor yaitu PPAR gamma dengan kode pdb 2XKW.
Docking dilakukan menggunakan PLANTS. Simulasi molecular dynamics
menggunakan aplikasi GROMACS. Hasil penelitian dari delapan belas senyawa
ligan biji buah nangka diperoleh nilai score CHEMPLP terendah dan memenuhi
syarat Lipinski’s Rule of Five adalah kuwanon c dengan nilai -98.0631 kkal/mol.
Pada simulasi molecular dynamics dilihat parameter yaitu energi potensial,
RMSD, RMSF. Hasil trajektori kuwanon c molecular dynamic yang fluktuatif dan
cenderung tidak stabil. Dapat disimpulkan kuwanon c tidak stabil maka dari itu
tidak dijadikan kandidat obat antidiabetes melitus tipe 2.
Kata Kunci: Diabetes Melitus Tipe 2, Ppargamma, Molecular Docking,
Molecular Dynamic.

Item Type:	Thesis (Bachelor)
Subjects:	R Medicine R Medicine > RS Pharmacy and materia medica
Divisions:	Fakultas Farmasi dan Sains > Farmasi
Depositing User:	libffs libffs libffs
Date Deposited:	02 Apr 2023 11:03
Last Modified:	02 Apr 2023 11:03
URI:	http://repository.uhamka.ac.id/id/eprint/22146

Actions (login required)

View Item