%0 Journal Article
%A Yeni, Yeni
%A Daryono Hadi Tjahjono, Daryono
%A UHAMKA,
%F repository:788
%I Farmasains
%J HOMOLOGY MODELING EPITOP ISOCITRATE DEHYDROGENASE TIPE 1 (R132H) MENGGUNAKAN MODELLER, I-TASSER DAN (PS)2 UNTUK VAKSIN GLIOMA
%T HOMOLOGY MODELING EPITOP ISOCITRATE DEHYDROGENASE TIPE 1 (R132H) MENGGUNAKAN MODELLER, I-TASSER DAN (PS)2 UNTUK VAKSIN GLIOMA
%U http://repository.uhamka.ac.id/id/eprint/788/
%X Glioma merupakan jenis tumor otak ganas primer. Adanya glioma dapat ditandai  dengan mutasi R132H pada Isocitrate dehydrogenase tipe 1 (IDH1). IDH1  (R132H) yang mengandung epitop imunogenik yang spesifik terhadap tumor dan  cocok untuk dijadikan vaksin perlu diketahui strukturnya. Oleh karena itu, perlu  dilakukan homology modeling epitop IDH1 (R132H). TMHMM, MEMSAT-SVM dan  MEMSAT3 digunakan untuk memprediksi topologi transmembran IDH1 (R132H).  Analisis epitop-epitop IDH1 (R132H) dilakukan menggunakan NetMHCII dan  IEDB. Epitop-epitop hasil analisis diprediksi antigenisitasnya dengan  menggunakan VaxiJen sehingga didapatkan 91 epitop. Homology modeling  epitop-epitop yang memiliki kemungkinan sebagai antigen dilakukan dengan  menggunakan Modeller, I-TASSER dan (PS)2. Hasil homology modeling epitopepitop  IDH1 (R132H) divalidasi dengan MolProbity, ProSA-web dan QMEAN.  Kemudian dipilih satu model 3D dari tiga model hasil homology modeling untuk  setiap epitop dan dilakukan refinement pada struktur Epitop-1 sampai Epitop-91  dengan menggunakan GalaxyRefine dan GROMACS untuk minimisasi energi.