%X Tuberkulosis (TB) merupakan penyakit yang disebabkan oleh bakteri
Mycobacterium tuberkulosis (MTB) yang dapat ditularkan melalui droplet.
Penggunaan herba timi (Thymus vulgaris) merupakan salah satu senyawa tanaman
alam yang sudah diteliti kandungan minyak atsirinya dan memiliki aktivitas
menghambat pertumbuhan bakteri MTB. Tujuan penelitian ini untuk memprediksi
kandidat pada senyawa dalam minyak atsiri dari herba timi terhadap Glutamate
racemase (Murl) pada dinding sel bakteri MTB menggunakan obat pembanding
yaitu ethambutol. Metode penelitian ini menggunakan metode molecular docking
dengan software Autodock untuk memprediksi senyawa dalam minyak atsiri dari
herba timi yang memiliki potensi terbaik sebagai antituberkulosis dilihat dari
energy binding, klaster, dan Ki serta metode molecular dynamics dengan software
GROMACS untuk mengetahui kestabilan melalui analisis energi potensial, RMSD,
RMSF, Girasi, dan energi MMPBSA. Hasil penelitian dengan metode simulasi
molecular docking menunjukkan senyawa Tymoquinone dan γ-Eudesmol
diprediksi memiliki afinitas yang baik dan hasil dari metode simulasi molecular
dynamics berdasarkan parameter energi MMPBSA menunjukan bahwa γ-Eudesmol
menunjukan kestabilan yang baik selama simulasi. Simpulan dari penelitian ini
yaitu senyawa minyak atsiri dari herba timi yakni γ-Eudesmol diprediksi berpotensi
sebagai kandidat obat antituberkulosis.
Kata Kunci: Molecular Docking, Molecular Dynamics, Minyak Atsiri Herba Timi,
Antituberkulosis, dan Glutamate racemase
%A Zeta Rukhshah Zam Zamy Nur
%A Rizky Arcinthya Rachmania
%A Hariyanti Hariyanti
%L repository21773
%T MOLECULAR DOCKING DAN MOLECULAR DYNAMICS SENYAWA
MINYAK ATSIRI HERBA TIMI (Thymus vulgaris) SEBAGAI
ANTITUBERKULOSIS TERHADAP GLUTAMATE RACEMASE (Murl)
%I Universitas Muhammadiyah Prof. DR. HAMKA
%D 2020