relation: http://repository.uhamka.ac.id/id/eprint/21773/
title: MOLECULAR DOCKING DAN MOLECULAR DYNAMICS SENYAWA  MINYAK ATSIRI HERBA TIMI (Thymus vulgaris) SEBAGAI  ANTITUBERKULOSIS TERHADAP GLUTAMATE RACEMASE (Murl)
creator: Nur, Zeta Rukhshah Zam Zamy
creator: Rachmania, Rizky Arcinthya
creator: Hariyanti, Hariyanti
subject: R Medicine
subject: RS Pharmacy and materia medica
description: Tuberkulosis (TB) merupakan penyakit yang disebabkan oleh bakteri  Mycobacterium tuberkulosis (MTB) yang dapat ditularkan melalui droplet.  Penggunaan herba timi (Thymus vulgaris) merupakan salah satu senyawa tanaman  alam yang sudah diteliti kandungan minyak atsirinya dan memiliki aktivitas  menghambat pertumbuhan bakteri MTB. Tujuan penelitian ini untuk memprediksi  kandidat pada senyawa dalam minyak atsiri dari herba timi terhadap Glutamate  racemase (Murl) pada dinding sel bakteri MTB menggunakan obat pembanding  yaitu ethambutol. Metode penelitian ini menggunakan metode molecular docking  dengan software Autodock untuk memprediksi senyawa dalam minyak atsiri dari  herba timi yang memiliki potensi terbaik sebagai antituberkulosis dilihat dari  energy binding, klaster, dan Ki serta metode molecular dynamics dengan software  GROMACS untuk mengetahui kestabilan melalui analisis energi potensial, RMSD,  RMSF, Girasi, dan energi MMPBSA. Hasil penelitian dengan metode simulasi  molecular docking menunjukkan senyawa Tymoquinone dan γ-Eudesmol  diprediksi memiliki afinitas yang baik dan hasil dari metode simulasi molecular  dynamics berdasarkan parameter energi MMPBSA menunjukan bahwa γ-Eudesmol  menunjukan kestabilan yang baik selama simulasi. Simpulan dari penelitian ini  yaitu senyawa minyak atsiri dari herba timi yakni γ-Eudesmol diprediksi berpotensi  sebagai kandidat obat antituberkulosis.  Kata Kunci: Molecular Docking, Molecular Dynamics, Minyak Atsiri Herba Timi,  Antituberkulosis, dan Glutamate racemase
date: 2020
type: Thesis
type: NonPeerReviewed
format: text
language: en
identifier: http://repository.uhamka.ac.id/id/eprint/21773/1/FS03-220037.pdf
identifier:   Nur, Zeta Rukhshah Zam Zamy dan Rachmania, Rizky Arcinthya dan Hariyanti, Hariyanti  (2020) MOLECULAR DOCKING DAN MOLECULAR DYNAMICS SENYAWA MINYAK ATSIRI HERBA TIMI (Thymus vulgaris) SEBAGAI ANTITUBERKULOSIS TERHADAP GLUTAMATE RACEMASE (Murl).  Bachelor thesis, Universitas Muhammadiyah Prof. DR. HAMKA.