eprintid: 21268
rev_number: 8
eprint_status: archive
userid: 3858
dir: disk0/00/02/12/68
datestamp: 2023-02-17 07:48:11
lastmod: 2023-02-17 07:48:11
status_changed: 2023-02-17 07:48:11
type: thesis
metadata_visibility: show
creators_name: FAUZI, NAUFAL RESTU
creators_name: Permanasari, Etin Diah
creators_name: Ladeska, Vera
title: IDENTIFIKASI ISOLAT MIKROBA ENDOFIT DAUN SALAM (Syzgium
polyanthum (Wight.) Walp.) PENGHASIL INHIBITOR XANTIN
OKSIDASE MENGGUNAKAN GEN 16S rRNA DAN GEN ITS
ispublished: pub
subjects: R
subjects: RS
divisions: 48201
abstract: Mikroba Endofit merupakan mikroorganisme hidup di dalam tanaman inang yang
terdiri dari bakteri, kapang, khamir yang dapat menghasilkan suatu senyawa
metabolit sekunder dan dapat dikembangkan sebagai sumber bahan obat. Penelitian
sebelumnya menjelaskan bahwa bakteri dan kapang endofit memiliki aktivitas
inhibitor xantin oksidase. Tujuan dari penelitian ini yaitu untuk mengidentifikasi
spesies bakteri dan kapang endofit daun salam (Syzgium polyanthum (Wight.)
Walp.) sebagai penghasil inhibitor xantin oksidase dengan menggunakan Gen 16S
rRNA pada bakteri dan Gen ITS pada kapang. Hasil isolasi DNA pada bakteri dan
kapang endofit daun salam menghasilkan pita DNA di atas 10.000 bp dengan
menggunakan kit dari Viogene. Isolat DNA Bakteri dengan kode BDS1
diamplifikasi menggunakan gen 16S rRNA dengan primer 63F dan 1387r. Isolat
kapang dengan kode KDS1 diamplifikasi menggunakan gen ITS dengan primer
ITS5 dan ITS4. Amplifikasi pada bakteri dan kapang menghasilkan pita DNA
sebesar 1500bp dan 600bp. Pada penelitian ini, isolat bakteri dengan kode BDS1
berhasil diidentifikasi secara molekuler dengan memiliki kemiripan terhadap
Bacillus aerius strain 24K sebesar 97,65%. Isolat kapang dengan kode KDS1
memiliki kemiripan dengan Colletotrichum asianum ICMP 18580 sebesar 99,47%.
Kata Kunci: Mikroba Endofit, Daun Salam (Syzgium polyanthum (Wight.) Walp.)
 Bakteri, Kapang, Gen 16S rRNA, Gen ITS
date: 2021
date_type: completed
full_text_status: public
institution: Universitas Muhammadiyah Prof. DR. HAMKA
department: Fakultas Farmasi dan Sains
thesis_type: bachelor
thesis_name: bphil
referencetext: Bio-Rad. 2017. Horizontal Electrophoresis Protocol. Bio-Rad Laboratories. United
States of America. Hlm. 1.
Buwono, Kurniawati N, Iqbal M. 2016. Analisis Perbandingan Metode Isolasi DNA
Untuk Deteksi White Spot Syndrome Virus (WSSV) Pada Udang Vaname
(Litopenaeus vannamei). Jurnal Perikanan Kelautan. 7(1): 54–65.
Chun ML, Chen CS, Chen CT, Liang YC, Lin J. 2002. Molecular modeling of
flavonoids that inhibits xanthine oxidase. Annales de Pathologie. (HS1): 167–
172.
Clarridge JE. 2004. Impact of 16S rRNA gene sequence analysis for identification
of bacteria on clinical microbiology and infectious diseases. Clinical
Microbiology Reviews. 17(4): 840–862.
Departemen Kesehatan Republik Indonesia. 2008. Farmakope Herbal Indonesia
Edisi I. Jakarta. Hlm.119.
Dianati NA. 2010. Gout and hyperuricemia. Comprehensive Therapy. 3(4): 3–13
Dinata DI. 2009. Bioteknologi Pemanfaatan Mikroorganisme dan Teknologi
Bioproses. EGC. Jakarta. Hlm. 91.
Dwita D. 2016. Pengaruh Pemberian Air Rebusan Daun Salam (Syzgium
polyanthum) Terhadap Penurunan Kadar Asam Urat. Jurnal Ipteks Terapan.
10(2): 117.
Fatchiyah, Arumingtyas EL, Widyarti S, Rahayu S. 2011. Biologi Molekular
Prinsip Dasar Analisis. Penerbit Erlangga. Jakarta. Hlm. 8-115.
Ikhwan HA, Arizal FR, Mukhlishoh SS. 2018. Skrining Fitokimia Ekstrak nHeksan Korteks Batang Salam (Syzygium polyanthum). Journal Chemistry
Science. 7(1): 1–4.
Iwen PC, Hinrichs SH, Rupp ME. 2002. Utilization of the internal transcribed
spacer regions as molecular targets to detect and identify human fungal
pathogens. Medical Mycology. 40(1): 88–89.
Jollès P. 1984. Review: What’s new in lysozyme research? Molecular and Cellular
Biochemistry. 63(2): 165–189.
Joshi M, Deshpande JD. 2010. Polymerase Chain Reaction: Methods, Principles
and Application. International Journal of Biomedical Research. 2(1): 81-97.
Kumala S. 2014. Mikroba Endofit Pemanfaatan Endofit dalam Bidang Farmasi. 
Edisi I. ISFI. Jakarta. Hlm. 15-109.
Legiastuti TS, Aminingsih T. 2012. Identifikasi Cendawan Endofit Menggunakan
Teknik Polymerase Chain Reaction. Jurnal Fitopatologi Indonesia. 2(8): 31–
36.
Lin S, Zhang G, Liao Y, Pan J, Gong D. 2015. Dietary Flavonoids as Xanthine
Oxidase Inhibitors: Structure-Affinity and Structure-Activity Relationships.
Journal of Agricultural and Food Chemistry. 35(63): 1.
Maftuchah, Winaya A, Zainudin A. 2014. Teknik Dasar Analisis Biologi Molekuler.
Deepublish. Yogyakarta. Hlm. 77.
Maheshwari DK. 2017. Endophytes: Biology and Biotechnology. Springer. Hlm. 2-
9.
Maksum I, Sriwidodo, Gaffar S, Hasan K, Subroto T., Soemitro S. 2017. Teknik
Biologi Molekular. Alqaprint Jatinangor. Bogor. Hlm. 1-47
Misnadiarly. 2014. REMATIK: Asam Urat-Hiperurisemia. Pustaka Obor Populer.
Jakarta. Hlm. 9.
Muhammad IR, Hariandja EM. 2015. Review : Aktivitas Farmakologis , Senyawa
Aktif , dan Mekanisme Kerja Daun Salam ( Syzygium polyanthum ).
Perkembangan Terkini Sains Farmasi Dan Klinik.
Mursadam, Wildan, Ramdani A. 2017. Bakteri Endofit Kulit Batang Tanaman
Cengkeh (Syzygium aromaticum L.) dan Kemampuannya Sebagai Antibakteri.
Jurnal Penelitian Pendidikan IPA (JPPIPA). 02(03): 58.
Nasrul E, Sofitri S. (2012). Hiperurisemia pada Pra Diabetes. Jurnal Kesehatan
Andalas. 1(2): 86–91.
Nurhayati B, Darmawati S. 2017. Biologi Sel dan Molekuler. Kementrian
Kesehatan Republik Indonesia. Jakarta. Hlm. 139-235.
Op De Beeck, Lievens B, Busschaert P, Colpaert JV. 2014. Comparison and
validation of some ITS primer pairs useful for fungal metabarcoding studies.
PLoS ONE. 9(6): 1-11.
Pangastuti A. 2006. Definisi Spesies Prokaryota Berdasarkan Urutan Basa Gen
Penyandi 16s rRNA dan Gen Penyandi Protein. Biodiversitas. 7(3): 292–296.
Pratiwi ST. 2008. Mikrobiologi Farmasi. Erlangga, Jakarta. Hlm. 150-170.
Purnamasari MI, Prihatna C, Gunawan AW, Suwanto A. 2012. Isolasi dan
Identifikasi secara Molekuler Ganoderma spp. yang Berasosiasi dengan
Penyakit Busuk Pangkal Batang di Kepala Sawit. Jurnal Fitopatologi 
Indonesia. 8(1): 9-15.
Rahayu DA, Nugroho ED. 2015. Biologi Molekuler dalam Perspektif
Konservasi.Plantaxia. Yogyakarta. Hlm. 40, 65, 80-81, 87-88, 100-101.
Rinanda T. 2011. Analisis Sekuensing 16S rRNA di Bidang Mikrobiologi. Jurnal
Kedokteran Syiah Kuala. 11(3): 172-177.
Shahid M, Srivastava M, Kumar V, Singh A, Sharma A, Pandey S, Rastogi S,
Pathak N, Srivastava AK. 2014. Phylogenetic Diversity Analysis of
Trichoderma Species Based on Internal Transcribed Spacer (ITS) Marker.
African Journal of Biotechnology. 13(3): 450.
Soltis DE, Soltis PS, Doyle JJ. 1998. Molecular Systemics of Plants II: DNA
Sequencing. Kluwer Academic Publisher. Massachusetts. Hlm.17-28.
Triani N. 2020. Isolasi Dna Tanaman Jeruk Dengan Menggunakan Metode Ctab
(Cetyl Trimethyl Ammonium Bromide). Jurnal Teknologi Terapan: G-Tech.
3(2): 221–226.
USDA. 2020. Clasification of Syzygium polianthum.National Agricultural Library.
USA. Hlm. 1
Widowati T, Bustanussalam, Harmastini S, Partomuan S. 2016. Isolasi dan
Identifikasi Kapang Endofit dari Tanaman Kunyit (Curcuma longa L.) Sebagai
Penghasil Antioksidan. Biopropal Industri.7(1):9-16.
Yuwono T. 2005. Biologi Molekular. Penerbit Erlangga. Jakarta.Hlm. 35-77.
citation:   FAUZI, NAUFAL RESTU dan Permanasari, Etin Diah dan Ladeska, Vera  (2021) IDENTIFIKASI ISOLAT MIKROBA ENDOFIT DAUN SALAM (Syzgium polyanthum (Wight.) Walp.) PENGHASIL INHIBITOR XANTIN OKSIDASE MENGGUNAKAN GEN 16S rRNA DAN GEN ITS.  Bachelor thesis, Universitas Muhammadiyah Prof. DR. HAMKA.   
document_url: http://repository.uhamka.ac.id/id/eprint/21268/1/FS03-210359.pdf