eprintid: 21234
rev_number: 8
eprint_status: archive
userid: 3858
dir: disk0/00/02/12/34
datestamp: 2023-02-15 03:51:27
lastmod: 2023-02-15 03:51:27
status_changed: 2023-02-15 03:51:27
type: thesis
metadata_visibility: show
creators_name: Saputra, Rhevo Dharma
creators_name: Rachmania, Rizky Arcinthya
creators_name: Hariyanti, Hariyanti
title: MOLECULAR DOCKING DAN MOLECULAR DYNAMIC SENYAWA
DAUN KETUMBAR (Coriandrum sativum Lam.) TERHADAP
ANGIOTENSIN CONVERTING ENZYME SEBAGAI
ANTIHIPERTENSI
ispublished: pub
subjects: R
subjects: RS
divisions: 48201
abstract: Daun ketumbar merupakan salah satu tanaman yang memiliki khasiat sebagai
antihipertensi. Fraksi etil asetat daun ketumbar golongan flavonoid dapat
menghambat Angiotensin Converting Enzyme yang berperan dalam meningkatkan
kadar angiotensin II pada proses terjadinya hipertensi. Tujuan dari penelitian ini
untuk mengetahui dan mendapatkan kandidat senyawa pada daun ketumbar
sebagai kandidat obat antihipertensi. Penelitian ini menggunakan metode simulasi
molecular docking dengan software Autodock serta metode simulasi molecular
dynamics dengan software GROMACS. Hasil penelitian dengan metode simulasi
molecular docking menunjukkan senyawa Luteolin diprediksi memiliki afinitas
terbaik dengan nilai energi bebas ikatan -6,95 kkal/mol, jumlah cluster 34 dan KI
8,09 uM sedangkan Captopril memiliki nilai energi bebas ikatan -6,18 kkal/mol,
jumlah cluster 5 dan KI 29,76 uM. Pada hasil simulasi molecular dynamic melalui
nilai MM-PBSA sebagai end point menunjukkan nilai energi bebas ikatan
Luteolin sebesar -53,031 kJ/mol sedangkan Captopril memiliki nilai energi bebas
ikatan sebesar -46,708 kJ/mol. Kesimpulan penelitian ini senyawa Luteolin dari
fraksi etil asetat daun ketumbar memiliki afinitas dan tingkat kestabilan yang lebih
baik dibandingkan dengan Captopril sehingga dapat dijadikan kandidat obat
antihipertensi.
Kata kunci: Coriandrum sativum, Angiotensin Converting Enzyme,
Antihipertensi, Molecular Docking, Molecular Dynamic.
date: 2020
date_type: completed
full_text_status: public
institution: Universitas Muhammadiyah Prof. DR. HAMKA
department: Fakultas Farmasi dan Sains
thesis_type: bachelor
thesis_name: bphil
referencetext: Aaronson, P, I., & Ward, J, P, T. (2010). At a Glance Sistem Kardiovaskular.
Jakarta, Indonesia : Erlangga, 77.
Al-Snafi, A, E. (2016). A review on chemical constituents and pharmacological
activities of Coriandrum sativum. IOSR Journal of Pharmacy, 6(7), 17–42.
Arba, M. (2019). Buku Ajar Farmasi Komputasi. Yogyakarta, Indonesia :
Deepublish, 150-166.
Baharvand-Ahmadi, B., Bahmani, M., Tajeddini, P., Rafieian-Kopaei, M., &
Naghdi, N. (2016). An ethnobotanical study of medicinal plants administered
for the treatment of hypertension. Journal of Renal Injury Prevention, 5(3),
123–128.
Cozier, G, E., Arendse, L, B., Schwager, S, L., Sturrock, E, D., & Acharya, K, R.
(2018). Molecular Basis for Multiple Omapatrilat Binding Sites within the
ACE C-Domain: Implications for Drug Design. Journal of Medicinal
Chemistry, 61(22), 10141–10154.
Dermawan, D., Sumirtanurdin, R., & Dewantisari, D. (2019). Molecular
Dynamics Simulation of Estrogen Receptor Alpha Against Andrografolid as
Anti Breast Cancer Simulasi Dinamika Molekular Reseptor Estrogen Alfa
dengan Andrografolid sebagai Anti Kanker Payudara. Indonesian Journal of
Pharmaceutical Science and Technology, 6(2), 65-76.
Duke, J., Bogenschutz-Godwin, M., Du, C., & Duke, P. (2002). Handbook of
Medicinal Herbs (2nd edn). Boca Raton, Florida : CRC Press, 222
Harmita, A, A, K, D., Hayun., & Harahap, Y. (2014). Kimia Medisinal. Jakarta,
Indonesia : EGC, 72-74.
Hussain, F., Jahan, N., Rahman, K., Sultana, B., & Jamil S. (2018). Identification
of hypotensive biofunctional compounds of Coriandrum sativum and
evaluation of their Angiotensin-Converting Enzyme (ACE) inhibition
potential. Oxidative Medicine and Cellular Longevity, 2018(11), 1-11.
Kementerian Kesehatan RI. (2018). Hasil Utama Riset Kesehatan Dasar. Jakarta,
Indonesia : Bakti Husada, 82.
Kumari, R., Kumar, R., & Lynn, A. (2014). G-mmpbsa -A GROMACS tool for
high-throughput MM-PBSA calculations. Journal of Chemical Information
and Modeling, 54(7), 1951–1962. 
Lemkul, J, A. (2015). Molecular Simulation Methods with Gromacs, Hands-on
tutorial Introduction to Molecular Dynamics: Simulation of Protein Ligand
Complex. Blacksburg, Virginia : Lemkul Lab, 1–14.
Lewars, E, G. (2016). In Computational Chemistry: Introduction to the Theory
and Applications of Molecular and Quantum Mechanics: Third Edition 2016.
Peterborough Ontario, Canada : Spinger, 1-5.
Lipinski, C, A. (2016). Rule of five in 2015 and beyond: Target and ligand
structural limitations, ligand chemistry structure and drug discovery project
decisions. Advanced Drug Delivery Reviews, 101(4), 34–41.
Manna, A., Laksitorini, M, D., Hudiyanti, D., & Siahaan P. (2017). Molecular
Docking of Interaction between E-Cadherin Protein and Conformational
Structure of Cyclic Peptide ADTC3 (Ac-CADTPC-NH2) Simulated on 20
ns. Jurnal Kimia Sains Dan Aplikasi, 20(1) : 30.
Mishra, S., Ojha, K, K., Pandey, P, N., & Shukla A. (2018). Trends in
Bioinformatics In silico Studies for Potential Natural Inhibitors for Isocitrate
Dehydrogenase Type II of Mycobacterium tuberculosis ( H37Rv ). Trends in
Bioinformatics, 11(1), 7–16.
Morris, G., David., Goodsell., Pique, M., Lindstrom, W., Huey, R., Forli, W.,
Halliday, S., Belew, R,, & Olson A. (2012). User Guide AutoDock Version
4.2. California, United States : The Scripps Research Institute, 1–66.
Muchtaridi., Yusuf, M., & Megantara, S. (2017). Penambatan Molekul
(Molecular Docking). Yogyakarta, Indonesia : Deepublish, 5.
Neamsuvan, O., Komonhiran, P., & Boonming, K. (2018). Medicinal plants used
for hypertension treatment by folk healers in Songkhla province, Thailand.
Journal of Ethnopharmacology, 214(3), 58–70.
Oliveira, T, V, D., Guimarães, A, P., Bressan, G, C., Maia, E, R., Coimbra, J, S,
R., Polêto, M, D., & Oliveira, E, B, D. (2020). Structural and molecular
bases of angiotensin-converting enzyme inhibition by bovine casein-derived
peptides: an in silico molecular dynamics approach. Journal of Biomolecular
Structure and Dynamics, 10(1), 1–18.
Priya, P., Kesheri, M., Sinha, R, P., & Kanchan, S. (2016). Molecular Dynamics
Simulations for Biological Systems. Kolkata, India : IGI Global, 300.
Purnomo, H. (2013). Kimia Komputasi Untuk Farmasi dan Ilmu Terkait : Uji InSilico Senyawa Antikanker. Yogyakarta, Indonesia : Pustaka Pelajar, 76-141.
Purwanto, Hardjono S. (2016). Hubungan Struktur, Ikatan Kimia dan Aktivitas
Biologis Obat. Dalam : Siswandono (ed). Kimia Medisinal edisi kedua.
Surabaya, Indonesia : Airlangga University Press, 227-244.
Rachmania R, A., Hariyanti., Zikriah, R., & Soultan, A. (2018). Studi In Silico
Senyawa Alkaloid Herba Bakung Putih (Crinum Asiaticum L.) pada
Penghambatan Enzim Siklooksigenase (COX) In Silico Study of Alkaloid
Herba Bakung Putih (Crinum Asiaticum L.) on Inhibition of Cyclooxygenase
Enzyme (COX). Jurnal Kimia Valensi, 4(11), 124–136.
Setiati, S., Alwi, I., Sudoyo, A, W., Simadibrata, M, K., Setiyohadi, B., & Syam,
A. (2015). Ilmu Penyakit Dalam Edisi keenam Jilid II Edisi VI. Jakarta,
Indonesia : Interna Publishing, 2262-2268
Simanjuntak, R, M. (2015). Analisis Dinamika Molekuler Hasil Penambatan
Molekuler Kompleks α-Glukosidase dengan Sepuluh Senyawa Kimia
Tanaman Hasil Virtual Screening dari Basis Data Herbal. Skripsi. Depok :
Fakultas Farmasi Universitas Indonesia, 63-66.
Sinaga, E. (2012). Biokimia Dasar. Jakarta, Indoensia : PT ISFI Penerbitan, 99.
Singh, D., Tanwar, A., & Agrawal P. (2015). An Overview on Coriander. Journal
of Biomedical and Pharmaceutical Research, 4(2), 67.
Soenarto, A, A., Erwinanto., Mumpuni, A, S, S., Barack, R., Lukito, A, A., &
Pratikto, R, S. (2015). Pedoman Tatalaksana Hipertensi Pada Penyakit
Kardiovaskular Edisi Pertama. Jakarta, Indonesia : Perhimpunan Dokter
Spesialis Kardiovaskular Indonesia, 1.
Sudoyo, A, W., Setiyohadi, B., Alwi, I., Simadibrata, M, K., & Setiati S. (2009).
Ilmu Penyakit Dalam Jilid II Edisi V. Jakarta : Interna Publishing, 1079-
1082.
Susanti, N, M, P., Laksmiani, N, P, L., Noviyanti, N, K, M., Arianti, K, M., &
Duantara, I, K. (2019). Molecular Docking Terpinen-4-OL Sebagai
Antiinflamasi Pada Aterosklerosis Secara In Insiilico. Journal Of Chemistry,
13(2), 221–228.
Triyanto., & Endang. (2014). Pelayanan Keperawatan Bagi Penderita Hipertensi
Secara Terpadu. Yogyakarta, Indonesia : Graha Ilmu, 9.
Wells, B, G., DiPiro, J, T., Schwinghammer, T, L., & DiPiro, C, V. (2015).
Pharmacotherapy handbook ninth edition. Missisipi, United States : Mc
Graw Hill Education, 87-88.
Yanuar, A. (2012). Penambatan Molekuler: Praktek dan Aplikasi pada Virtual
Screening. Depok, Indonesia : Fakultas Farmasi Universitas Indonesia, 122.
Yuniadi, Y., Hermanto, D, Y., & Rahajoe, A, U. (2017). Kardiovaskular Jilid 1.
Jakarta, Indoensia : Sagung Seto, 375.
citation:   Saputra, Rhevo Dharma dan Rachmania, Rizky Arcinthya dan Hariyanti, Hariyanti  (2020) MOLECULAR DOCKING DAN MOLECULAR DYNAMIC SENYAWA DAUN KETUMBAR (Coriandrum sativum Lam.) TERHADAP ANGIOTENSIN CONVERTING ENZYME SEBAGAI ANTIHIPERTENSI.  Bachelor thesis, Universitas Muhammadiyah Prof. DR. HAMKA.   
document_url: http://repository.uhamka.ac.id/id/eprint/21234/1/FS03-210332.pdf