eprintid: 13854
rev_number: 8
eprint_status: archive
userid: 2319
dir: disk0/00/01/38/54
datestamp: 2022-09-15 05:59:41
lastmod: 2022-09-15 05:59:41
status_changed: 2022-09-15 05:59:41
type: thesis
metadata_visibility: show
creators_name: Adawiyah, Azkiyah
creators_name: Priyo Wahyudi, Priyo
creators_name: Fitri Yuniarti, Fitri
creators_id: fitri_yuniarti@uhamka.ac.id
creators_orcid: 0000-0002-9233-1557
creators_orcid: 0000-0002-9233-1557
title: Penggunaan Gen 16s Rrna Pada Identifikasi Bakteri Endofit Isolat Daun Jambu Monyet (Anacardium Occidentale L.) Penghasil Antibakteri
ispublished: pub
subjects: RS
abstract: Daun jambu monyet mengandung senyawa bioaktif berupa flavonoid, tanin, dan
saponin yang memiliki aktivitas sebagai antibakteri. Senyawa aktif yang
terkandung tidak hanya berasal dari tanaman, tetapi dapat berasal dari mikroba
yang berada di dalam jaringan tanaman. Bakteri endofit merupakan bakteri
simbiotik yang hidup di dalam jaringan dan tidak menimbulkan efek negatif pada
tanaman inangnya. Bakteri endofit dapat menghasilkan senyawa metabolit
sekunder yang sama dengan tanaman inangnya. Penelitian ini bertujuan untuk
mengidentifikasi bakteri endofit isolat daun jambu monyet (Anacardium
occidentale L.) yang mempunyai aktivitas sebagai antibakteri menggunakan gen
16S rRNA yaitu marker spesifik untuk identifikasi bakteri hingga tingkat spesies.
Metode isolasi DNA total yang digunakan yaitu dengan bantuan Promega Wizard
Genomic DNA Purification Kit, lalu diamplikasi gen 16S rRNA dengan PCR,
kemudian hasil PCR disekuensing dan disejajarkan dengan data gen pada program
BLAST. Hasil BLAST menunjukkan bahwa isolat bakteri endofit daun jambu
monyet memiliki 99% kemiripan dengan Enterobacter cloacae strain ATCC
13047.

Kata Kunci: isolat daun jambu monyet (Anacardium occidentale L.), bakteri
endofit, gen 16S rRNA, sekuensing.
date: 2022-04-09
date_type: completed
full_text_status: restricted
institution: Universitas Muhammadiyah  Dr  Hamka
department: Fakultas Farmasi Dan Sains
thesis_type: bachelor
thesis_name: bphil
referencetext: Agedah CE, Bawo DDS, Nyananyo BL. 2010. Identification of Antimicrobial
Properties of Cashew Anacardium occidentale L. (Family Anacardiaceae).
Journal Applied Sciences Environmetal Management. 14(3): 25-27.
Agusta A. 2009. Biologi dan Kimia Jamur Endofit. Penerbit ITB. Bandung. Hlm.
1-34.
Aris M, Sukenda, Harris MF, Yuhan M. 2013. Identifikasi Molekuler Bakteri
Patogen dan Desain Primer PCR. Jurnal Budidaya Perairan. 1(3): 43-50.
Belonwu DC, Ibegbulem CO, Chikezie PC. 2014. Systemic Evaluation of
Antibacterial Activity of Anacardium occidentale. The Journal of
Phytopharmacology. 3(3): 193-199.
Bintang M, Ukhradiya MS, Dwi EK, Fachriyan HP, Tjandragita D. 2014.
Analysis of 16S rRNA Sequence of Endophytic Bacteria Isolate BS1 from
Piper betle (L.) Stem. International Conference on Agricultural,
Enviromental and Biological Science. 69-70.
Chabi SK, Sina H, Adoukonou SH, Ahoton LE, Roko GO, Saidou A, Adeoti K,
Ahanchede A, Baba ML. 2014. Antimicrobial Activity of Anacardium
occidentale L. Leaves and Barks Extracts on Pathogenic Bacteria. African
Journal of Microbiology Research. 8(25): 2458-2467.
Clarridge JE. 2004. Impact of 16S rRNA Gene Sequence Analysis for
Identification of Bacteria on Clinical Microbiology and Infectious
Diseases. Journal Clinical Microbiology Reviews. 17: 840-862.
Dahake AP, Joshi VD, Johsi AB. 2009. Antimicronial Screening of Different
Extract of Anacardium occidentale Linn Leaves. International Journal of
Chemical Technology Research. 1(4): 856-858.
Dalimartha S. 2000. Atlas Tanaman Obat. Jilid II. Trubus Agriwidya. Jakarta.
Hlm. 68.
Fatchiyah, Arumingtyas EL, Widyarti S, Rahayu S. 2011. Biologi Molekular
Prinsip Dasar Analisis. Erlanggga. Jakarta. Hlm. 22, 48-55, 112-115.
Felix F, Nugroho TT, Silalahi S, Octavia Y. 2011. Skrining Bakteri Vibrio sp.
Asli Indonesia Sebagai Penyebab Penyakit Udang Berbasis Tehnik 16S
Ribosomal DNA. Jurnal Ilmu dan Teknologi Kelautan Tropis. 3(2): 85-99.
Guarro J, Gene J, Stchigel AM. 1999. Development in Fungi Taxonomy. Clinical
Microbiology Reviews. 12(3): 454-500.
Janda JM, Abott LS. 2007. Minireview: 16 rRNA Gene Sequensing for Bacterial
Identification in the Diagnostic Laboratory: Pluses, Perils, and Pitfalls.
Journal of Clinical Microbiology. 45(9): 2791-2764.
Kumala S. 2014. Mikroba Endofit: Pemanfaatan Mikroba Endofit dalam Bidang
Farmasi. PT. ISFI Penerbitan. Jakarta. Hlm. 23-62.

Madigan MT, Martiko JM, Stahl DA, Clark DP. 2012. Brock Biology of
Microorganisms. 13th Edition. Wageningen Agricultural University.
Netherlands. Hlm. 129-130.
Muladno. 2010. Teknologi Rekayasa Genetika. Edisi II. Penerbit IPB Press.
Bogor. Hlm. 32.
Mustapha AA, Gabriel O, Jafar OO,Uthman I, Mukhtar MI. 2015. Phytochemical
Screening and Inhibitory Activities of Anacardium occidentale Leaves
Extracts Against Some Clinically Important Bacterial Isolates.
International Journal of Pharmacognosy and Phytochemical Research.
7(2): 365-369.
Nursanty R, Iqbar. 2013. Identifikasi Bakteri Endofit Asal Tanaman Belimbing
Wuluh. Jurnal Ilmiah Pendidikan Biologi, Biologi Edukasi. 5(1):36-38.
O'Brien HE, Jeri LP, Jason AJ, Jean MM, Rytas V. 2005. Fungal Communities
Analysis by Large-Scale Sequencing of Environmental Samples. Environ
Microbiology. (71): 5544-5550.
Pangastuti A. 2006. Definisi Spesies Prokaryota Berdasarkan Urutan Basa Gen
Penyandi 16S rRNA dan Gen Penyandi Protein. Jurnal Biodiversitasi.
7(3): 292-296.
Parida I, Tri AD, Giyanto. 2016. Isolasi, Seleksi, dan Identifikasi Bakteri Endofit
Agens Pengunduksi Ketahanan Padi terhadap Hawar Daun Bakteri. Jurnal
Fitopatologi Indonesia. 12(6):199-208.
Pratita MYE, Putra SR. 2012. Isolasi dan Identifikasi Bakteri Termofilik dari
Sumber Mata Air Panas di Songgoriti Setelah Dua Hari Inkubasi. Jurnal
Teknik Pomits. 1(1):1-5.
Pratiwi ST. 2008. Mikrobiologi Farmasi. Erlangga. Jakarta. Hlm. 150 – 171.
Promega Corporation. 2012. Go Taq Green Master Mix. USA.
Promega Corporation. 2014. Wizard Genomic DNA Purification. USA.
Purnamasari MI, Prihatna C, Gunawan AW, Suwanto A. 2012. Isolasi dan
Identifikasi secara Molekuler Ganoderma spp. yang Berasosiasi dengan
Penyakit Busuk Pangkal Batang di Kepala Sawit. Jurnal Fitopatologi
Indonesia. 8(1): 9-15.
Radji M. 2005. Peranan Bioteknologi dan Mikroba Endofit dalam Pengembangan
Obat Herbal. Majalah Ilmu Farmasi. 2(3): 113-126.
Radji M. 2011. Rekayasa Genetika. Sagung Seto. Jakarta. Hlm. 29-67.
Rahayu DA, Nugroho ED. 2015. Biologi Molekular dalam Perspektif Konservasi.
Plantaxia. Yogyakarta. Hlm. 40, 65, 80-81, 87-88, 100-101.
Rinanda T. 2011. Analisis Sekuensing 16 rRNA di Bidang Mikrobiologi. Jurnal
Kedokteran Syiah Kuala. 11(3): 172-177.
Rosenblueth M, Esperanza MR. 2006. Bacterial Endophytes and Their
Interactions with Hosts Review. The American Phytopathological Society.
19(8): 827-837.

Saptadi D, Sri H, Asep S, Bambang H, Surdarsono. 2011. Pengembangan Marka
Simple sequence Repeat untuk Jatropha spp. Jurnal Littri.17(4) : 140-
149.
Schmeisser C, Steele H, Streit WR. 2007. Metagenomics, Biotechnology with
Non-Culturable Microbes. Applied Microbiology Biotechnology. 75: 955-
962.
Strobel G, Daisy B. 2003. Bioprospecting for Microbial Endophytes and Their
Natural Products. Microbiology and Molecular Biology Reviews. 67(4):
492-497.
Sulistyawati D, Sri M. 2009. Uji Aktivitas Antijamur Infusa Daun Jambu Mete
(Anacardium occidentale L) terhadap Candida albicans. Biomedika. 2(1) :
47-50.
Syamsuhidayat SS, Hutapea JR. 2000. Inventaris Tanaman Obat Indonesia. Jilid
1. Badan Penelitian dan Pengembangan. Departemen Kesehatan RI.
Jakarta. Hlm. 15-16.
Toha AHA. 2010. Ensiklopedia Biokimia dan Biologi Molekuler. EGC. Jakarta.
Hlm. 619-720.
Utami P. 2008. Buku Pintar Tanaman Obat: 431 Jenis Tanaman Penggempur
Aneka Penyakit. Agromedika Pustaka. Jakarta. Hlm. 214.
Yuniarti T. 2008. Ensiklopedia Tanaman Obat Tradisional. MedPress.
Yogyakarta. Hlm. 65-67.
Yuwono T. 2005. Biologi Molekuler. Erlangga. Jakarta. Hlm. 35-211.
Zahra A. 2017. Aktivitas Antibakteri Metabolit Sekunder Mikroba Endofit Daun
Jambu Monyet (Anacardium occidentale L.) Terhadap Bakteri
Staphylococcus aureus dan Escheria coli Secara In Vitro. Skripsi. Fakultas
Farmasi dan Sains Universitas Muhammadiyah Prof. DR. HAMKA.
Jakarta.
citation:   Adawiyah, Azkiyah dan Priyo Wahyudi, Priyo dan Fitri Yuniarti, Fitri  (2022) Penggunaan Gen 16s Rrna Pada Identifikasi Bakteri Endofit Isolat Daun Jambu Monyet (Anacardium Occidentale L.) Penghasil Antibakteri.  Bachelor thesis, Universitas Muhammadiyah Dr Hamka.   
document_url: http://repository.uhamka.ac.id/id/eprint/13854/1/FFS_FARMASI_S03-190066_AZKIYAH%20ADAWIYAH.pdf